Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF879B4DU55 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF879B4DU55 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms