Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBR1LQ6UX01 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMBR1LQ6UX01 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms