Protein–RNA interactions for Protein: O94900

TOX, Thymocyte selection-associated high mobility group box protein TOX, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOXO94900 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TOXO94900 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TOXO94900 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TOXO94900 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms