Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NECTIN3Q9NQS3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms