Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms