Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TCTE1Q5JU00 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TCTE1Q5JU00 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms