Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
CD300CQ08708 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
CD300CQ08708 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms