Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CACNA1BQ00975 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms