Protein–RNA interactions for Protein: P47756

CAPZB, F-actin-capping protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZBP47756 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CAPZBP47756 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CAPZBP47756 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms