Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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HOXA3O43365 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
HOXA3O43365 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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