Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL4Q9BPW4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms