Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AMER1Q5JTC6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AMER1Q5JTC6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms