Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZIC1Q15915 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZIC1Q15915 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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