Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ZNF548Q8NEK5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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ZNF548Q8NEK5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF548Q8NEK5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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