Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
COX18Q8N8Q8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms