Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VSIG10Q8N0Z9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms