Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIN52Q52LA3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms