Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB9Q9Y5E1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDHB9Q9Y5E1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms