Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRCH1Q9Y2L9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH1Q9Y2L9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRCH1Q9Y2L9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms