Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
BARX2Q9UMQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BARX2Q9UMQ3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BARX2Q9UMQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BARX2Q9UMQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.7 ms