Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ALKQ9UM73 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ALKQ9UM73 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ALKQ9UM73 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ALKQ9UM73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ALKQ9UM73 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms