Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF38Q9NXL2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF38Q9NXL2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARHGEF38Q9NXL2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF38Q9NXL2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms