Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TLR9Q9NR96 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
TLR9Q9NR96 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TLR9Q9NR96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR9Q9NR96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR9Q9NR96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TLR9Q9NR96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms