Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SCAF1Q9H7N4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SCAF1Q9H7N4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SCAF1Q9H7N4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SCAF1Q9H7N4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SCAF1Q9H7N4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.7 ms