Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC49.29■■■■■ 5.48
SCAF1Q9H7N4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.88■■■■■ 5.42
SCAF1Q9H7N4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC48.45■■■■■ 5.35
SCAF1Q9H7N4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC48.44■■■■■ 5.34
SCAF1Q9H7N4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
SCAF1Q9H7N4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
SCAF1Q9H7N4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
SCAF1Q9H7N4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SCAF1Q9H7N4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
SCAF1Q9H7N4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC47.16■■■■■ 5.14
SCAF1Q9H7N4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SCAF1Q9H7N4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
SCAF1Q9H7N4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
SCAF1Q9H7N4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SCAF1Q9H7N4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SCAF1Q9H7N4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SCAF1Q9H7N4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
SCAF1Q9H7N4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
SCAF1Q9H7N4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
SCAF1Q9H7N4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
SCAF1Q9H7N4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
SCAF1Q9H7N4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.93■■■■■ 4.94
SCAF1Q9H7N4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
SCAF1Q9H7N4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SCAF1Q9H7N4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
SCAF1Q9H7N4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
SCAF1Q9H7N4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.6■■■■■ 4.89
SCAF1Q9H7N4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
SCAF1Q9H7N4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC45.56■■■■■ 4.88
SCAF1Q9H7N4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.47■■■■■ 4.87
SCAF1Q9H7N4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
SCAF1Q9H7N4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.4■■■■■ 4.86
SCAF1Q9H7N4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.36■■■■■ 4.85
SCAF1Q9H7N4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
SCAF1Q9H7N4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SCAF1Q9H7N4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC45.19■■■■■ 4.82
SCAF1Q9H7N4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SCAF1Q9H7N4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
SCAF1Q9H7N4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
SCAF1Q9H7N4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC44.77■■■■■ 4.76
SCAF1Q9H7N4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
SCAF1Q9H7N4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
SCAF1Q9H7N4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
SCAF1Q9H7N4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SCAF1Q9H7N4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC44.43■■■■■ 4.7
SCAF1Q9H7N4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SCAF1Q9H7N4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
SCAF1Q9H7N4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
SCAF1Q9H7N4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.3■■■■■ 4.68
SCAF1Q9H7N4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
SCAF1Q9H7N4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SCAF1Q9H7N4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SCAF1Q9H7N4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SCAF1Q9H7N4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SCAF1Q9H7N4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
SCAF1Q9H7N4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
SCAF1Q9H7N4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
SCAF1Q9H7N4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
SCAF1Q9H7N4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
SCAF1Q9H7N4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SCAF1Q9H7N4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SCAF1Q9H7N4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SCAF1Q9H7N4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
SCAF1Q9H7N4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SCAF1Q9H7N4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC43.7■■■■■ 4.59
SCAF1Q9H7N4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SCAF1Q9H7N4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
SCAF1Q9H7N4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
SCAF1Q9H7N4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SCAF1Q9H7N4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SCAF1Q9H7N4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SCAF1Q9H7N4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
SCAF1Q9H7N4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SCAF1Q9H7N4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SCAF1Q9H7N4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SCAF1Q9H7N4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
SCAF1Q9H7N4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SCAF1Q9H7N4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SCAF1Q9H7N4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SCAF1Q9H7N4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
SCAF1Q9H7N4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SCAF1Q9H7N4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SCAF1Q9H7N4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
SCAF1Q9H7N4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SCAF1Q9H7N4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SCAF1Q9H7N4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SCAF1Q9H7N4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
SCAF1Q9H7N4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
SCAF1Q9H7N4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SCAF1Q9H7N4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SCAF1Q9H7N4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC42.83■■■■■ 4.45
SCAF1Q9H7N4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
SCAF1Q9H7N4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
SCAF1Q9H7N4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SCAF1Q9H7N4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms