Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A1Q96NT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A1Q96NT5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC46A1Q96NT5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms