Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q6Q795 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q6Q795 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q6Q795 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q6Q795 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q6Q795 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6Q795 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6Q795 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6Q795 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q6Q795 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q6Q795 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q6Q795 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q6Q795 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6Q795 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6Q795 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6Q795 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6Q795 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q6Q795 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms