Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEL1L3Q68CR1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEL1L3Q68CR1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEL1L3Q68CR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms