Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
FRMPD1Q5SYB0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
FRMPD1Q5SYB0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
FRMPD1Q5SYB0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms