Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RAB3GAP1Q15042 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB3GAP1Q15042 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB3GAP1Q15042 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
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