Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CKAP5Q14008 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CKAP5Q14008 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CKAP5Q14008 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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