Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PKD2Q13563 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PKD2Q13563 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PKD2Q13563 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PKD2Q13563 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PKD2Q13563 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
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