Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDE3BQ13370 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDE3BQ13370 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
PDE3BQ13370 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PDE3BQ13370 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE3BQ13370 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
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