Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAF1AQ13111 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHAF1AQ13111 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHAF1AQ13111 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHAF1AQ13111 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms