Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NUP160Q12769 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
NUP160Q12769 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NUP160Q12769 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
NUP160Q12769 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC39.28■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NUP160Q12769 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
NUP160Q12769 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NUP160Q12769 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC39.12■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NUP160Q12769 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
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