Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPOXP50336 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPOXP50336 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPOXP50336 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPOXP50336 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPOXP50336 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPOXP50336 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPOXP50336 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPOXP50336 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPOXP50336 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPOXP50336 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PPOXP50336 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PPOXP50336 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PPOXP50336 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PPOXP50336 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPOXP50336 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPOXP50336 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPOXP50336 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPOXP50336 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PPOXP50336 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPOXP50336 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPOXP50336 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms