Protein–RNA interactions for Protein: P49821

NDUFV1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFV1P49821 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
NDUFV1P49821 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDUFV1P49821 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFV1P49821 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms