Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LRPPRCP42704 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LRPPRCP42704 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LRPPRCP42704 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LRPPRCP42704 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LRPPRCP42704 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms