Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CTNNB1P35222 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTNNB1P35222 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CTNNB1P35222 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms