Protein–RNA interactions for Protein: P34931

HSPA1L, Heat shock 70 kDa protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA1LP34931 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
HSPA1LP34931 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
HSPA1LP34931 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HSPA1LP34931 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HSPA1LP34931 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms