Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EIF4BP23588 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EIF4BP23588 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EIF4BP23588 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EIF4BP23588 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms