Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPREP23469 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPREP23469 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPREP23469 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPREP23469 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPREP23469 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPREP23469 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPREP23469 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPREP23469 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPREP23469 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPREP23469 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPREP23469 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPREP23469 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPREP23469 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPREP23469 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPREP23469 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPREP23469 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPREP23469 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPREP23469 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPREP23469 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPREP23469 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPREP23469 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PTPREP23469 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPREP23469 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPREP23469 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPREP23469 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPREP23469 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPREP23469 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPREP23469 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPREP23469 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPREP23469 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPREP23469 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPREP23469 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPREP23469 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPREP23469 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPREP23469 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPREP23469 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms