Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GP1BBP13224 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GP1BBP13224 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GP1BBP13224 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms