Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALAP11233 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALAP11233 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RALAP11233 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RALAP11233 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RALAP11233 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RALAP11233 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALAP11233 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RALAP11233 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RALAP11233 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALAP11233 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALAP11233 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALAP11233 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RALAP11233 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALAP11233 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALAP11233 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALAP11233 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALAP11233 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RALAP11233 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RALAP11233 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALAP11233 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALAP11233 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALAP11233 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RALAP11233 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RALAP11233 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALAP11233 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALAP11233 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALAP11233 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RALAP11233 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RALAP11233 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RALAP11233 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALAP11233 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALAP11233 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RALAP11233 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RALAP11233 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RALAP11233 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RALAP11233 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RALAP11233 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms