Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPSAP08865 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPSAP08865 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPSAP08865 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPSAP08865 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPSAP08865 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPSAP08865 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPSAP08865 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPSAP08865 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPSAP08865 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPSAP08865 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPSAP08865 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPSAP08865 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPSAP08865 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPSAP08865 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPSAP08865 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPSAP08865 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPSAP08865 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPSAP08865 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPSAP08865 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPSAP08865 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms