Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV2-5P01817 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IGHV2-5P01817 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IGHV2-5P01817 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IGHV2-5P01817 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms