Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNKO75909 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CCNKO75909 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CCNKO75909 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCNKO75909 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCNKO75909 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCNKO75909 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCNKO75909 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNKO75909 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNKO75909 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNKO75909 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNKO75909 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCNKO75909 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNKO75909 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNKO75909 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNKO75909 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCNKO75909 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCNKO75909 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCNKO75909 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCNKO75909 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNKO75909 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNKO75909 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCNKO75909 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCNKO75909 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNKO75909 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNKO75909 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCNKO75909 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms