Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC28A2O43868 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A2O43868 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms