Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PODXLO00592 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PODXLO00592 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PODXLO00592 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PODXLO00592 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PODXLO00592 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PODXLO00592 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PODXLO00592 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PODXLO00592 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PODXLO00592 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PODXLO00592 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PODXLO00592 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PODXLO00592 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PODXLO00592 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PODXLO00592 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PODXLO00592 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PODXLO00592 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PODXLO00592 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PODXLO00592 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PODXLO00592 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PODXLO00592 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PODXLO00592 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PODXLO00592 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PODXLO00592 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PODXLO00592 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PODXLO00592 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PODXLO00592 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PODXLO00592 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PODXLO00592 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PODXLO00592 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PODXLO00592 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PODXLO00592 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PODXLO00592 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PODXLO00592 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PODXLO00592 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PODXLO00592 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PODXLO00592 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PODXLO00592 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PODXLO00592 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PODXLO00592 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms