Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMD9O00233 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMD9O00233 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSMD9O00233 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms